Quelques avantages de Snort sur Prelude-IDS sont sa popularité et sa disponibilité sur de nombreuses plateformes. Prelude-IDS se restreint sur les plateformes POSIX alors que nous pouvons retrouver Snort aussi sur Windows. A cela s'ajoute l'importance de la base de données des signatures d'attaque de Snort, pour expliquer sa plus grande popularité. Mais Prelude-IDS est de plus en plus connu dans le monde des professionnels de la sécurité.
Une différence importante cependant, au désavantage de Snort : Snort est un NIDS pur alors que Prelude-IDS intègre des fonctionnalités NIDS et HIDS. Ce dernier est un IDS hybride. Dans la suite, nous ne comparerons que ce qui est comparable, c'est-à-dire la partie NIDS de Prelude-IDS et Snort.